Богатство выбора… или очередное TIMTOWTDI

• Несколько версий самого perl (разумеется, каждая со своими глобальными модулями), в т.ч. установленные в домашний каталог юзера (см. perlbrew).
• Глобальные (доступные при запуске perl) и локальные (подключаемые из любого каталога/каталогов, обычно располагающиеся внутри отдельного проекта или в домашнем каталоге пользователя) модули.
• Глобальные модули бывают трёх типов: core (идущие вместе с perl), site (устанавливаемые вручную админом) и vendor (устанавливаемые менеджером пакетов вашей ОС).
• Все глобальные модули находятся в подкаталогах «номер.версии.perl/», и эти каталоги никто автоматически не чистит. А при установке новой версии perl создаются новые аналогичные каталоги. И perl подгружает модули из каталогов всех доступных предыдущих версий. Так что умножьте core+site+vendor на количество обновлений perl — вот в таком количестве каталогов/вариантов находятся ваши глобальные модули.
• Источники модулей тоже бывают разные: CPAN, локальные зеркала-оверлеи CPAN с приватными модулями, просто свои или скачанные из инета модули отсутствующие в CPAN-совместимой системе.

• контейнерная виртуализация (на уровне операционной системы) — какая операционная система используется в физическом сервере — такие виртуальные машины можно в ней и создавать (Linux-Linux, Windows-Windows, xBSD-xBSD) — гомогенная виртуализация
• аппаратная виртуализация и паравиртуализация — на физическом сервере с одной операционной системой можно создавать виртуальные машины с иными ОС (Linux-Linux, Linux-Windows, Linux-xBSD, Windows-Linux, Windows-Windows ...) — гетерогенная виртуализация