Без всяких лирических отступления — ключевое слово xdotool.
xdotool умеет многое, но сейчас нас интересует её возможность нажатия кнопок мыши или изменения положения курсора:

• xdotool mousemove 50 100 — переместит курсор на точку с координатами 50.100
• xdotool mousemove_relative 10 0 — переместит курсор на 10 вправо
• xdotool click 1 — нажмет левую кнопку мыши

Ну и так далее, опций достаточно много — начиная от передвижения и заканчивая отпусканием кнопки мыши (а помимо работы с мышью есть ещё много чего что умеет xdotool)

Посему если есть желание управлять мышью, то просто вешаем на хоткеи на желаемые манипуляции с мышью.
К примеру, мне хватает малого, и в конфиге xchainkeys (а это для меня поудобнее чем xbindkeys) имеются строки

W-p Up :group xdotool mousemove_relative -- 0 -15
W-p Down :group xdotool mousemove_relative 0 15
W-p Right :group xdotool mousemove_relative 15 0
W-p Left :group xdotool mousemove_relative -- -15 0
W-p Return :group xdotool click 1

После нажания Win+p стрелками можно управлять курсором, а клавиша Enter будет равносильна нажатию левой кнопки мыши.

И всё это независимо от wm…

PS. В некоторых DE управление курсором мыши с нампада это штатная функция (ищите да обрящите)